APIK Indonesia Network memiliki kantor sekretariat nasional di Yogyakarta, dengan 7 kantor regional yang mewakili: Sumatera, Jawa, Bali-Nusa Tenggara, Sulawesi, Kalimantan, Maluku dan Papua wilayah yang terdiri dari 34 provinsi di Indonesia. Ada lebih dari 400 anggota yang terlibat dalam APIK Indonesia Network dari 62 universitas, 10 lembaga penelitian, 3 pusat pelatihan, Lembaga teknis kementerian, pemda dan lembaga lainnya.

Struktur Organisasi APIKI untuk tahun kepengurusan 2017-2020.